여름부터 가을까지 오랫동안 꽃이 피며, 물이 있는 곳에 주로 산다. 산수국의 꽃 색깔은 다양하여 처음에는 흰색으로 피었다가 푸른색이나 분홍색으로 변한다. 처음 산수국 꽃이 피기 시작할 때는 연녹색이 도는 흰색으로 시작되어 꽃이 피는 동안 안토시아닌이 합성되면서 푸른색으로 변하며, 꽃이 활짝 필 때는 붉은색이 된다. 또한, 꽃의 색깔은 흙의 산성도에 따라 달라지기도 한다. 산성 토양에서는 알루미늄이 이온화되어 뿌리에 흡수되면 안토시아닌과 결합하여 푸른색을 나타낸다. 그러나 알카리성인 흙에서는 알루미늄이 부족해 안토시아닌과 결합이 안 돼 꽃 색깔은 붉은색이 된다. 꽃은 6월~8월 무렵 희고 붉은색이 도는 하늘색으로 수술과 암술을 가운데 두고 앞에는 지름 2~3㎝가량의 무성화가 있다. 가장자리의 흰꽃은 열매를 맺지 못하는 가짜 꽃이고, 가운데는 암술과 수술이 있는 참꽃봉오리가 있다. 가장자리 꽃은 가짜꽃(무성화)으로 수술과 암술은 퇴화하여 열매를 맺지 못하며, 꽃잎처럼 보이는 화려한 꽃받침이 곤충을 유혹하는 역할을 한다. 가운데 꽃은 진짜꽃(유성화)으로 꽃잎이 작으나 암술, 수술을 가지고 있어 자손 번식을 위한 열매를 만든다. 산수국은 두 종류의 꽃에게 역할 분담을 시켜 불필요한 에너지 사용을 줄이며, 효율적인 관리 체계를 가지고 있다.